पोस्टमार्टम घड़ी को कैलिब्रेट करने का एक नया तरीका?
अलबामा स्टेट और वाशिंगटन स्टेट यूनिवर्सिटी की अध्ययन टीम ने अपनी परिकल्पना का परीक्षण करने के लिए दो पशु मॉडल का इस्तेमाल किया। ज़ेबरा मछली और चूहों का इस्तेमाल किया गया। अलग-अलग समय पर नियंत्रित परिस्थितियों में अपने विषयों को नष्ट करके, उन्होंने यह पता लगाने की कोशिश की कि क्या जीन अप-रेगुलेशन की दर मृत्यु के समय से संबंधित है।
यह पहली बार नहीं है जब आनुवंशिक सामग्री की जांच की गई है ताकि यह देखा जा सके कि क्या पीएमआई की गणना की जा सकती है। पिछले अध्ययनों में मृत्यु के समय को स्पष्ट करने के लिए मैसेंजर आरएनए (एमआरएनए) के क्षरण का उपयोग किया गया था। हालाँकि किसी विशेष mRNA के क्षरण की दर को मापने में दो बड़ी कमियाँ हैं जो पूर्वाग्रह और अशुद्धि का कारण बनती हैं; सबसे पहले, मौजूद mRNA की मात्रा को बढ़ाने के लिए पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन की आवश्यकता होती है और दूसरी बात, नमूनों की तुलना करने के लिए डेटा को नियंत्रण नमूने के साथ सामान्यीकृत करना पड़ता है।
mRNA क्षरण को मापने से जुड़ी अशुद्धियों को दूर करने के लिए, टीम ने 2011 में एक 'जीन मीटर' विकसित किया। जीन मीटर किसी दिए गए जैविक नमूने में किसी विशेष जीन की प्रचुरता को सटीक रूप से निर्धारित करता है (बिना प्रवर्धन के) और पारंपरिक डीएनए माइक्रो-एरे के साथ देखे जाने वाले 'शोर' द्वारा बनाई गई त्रुटि को भी समाप्त करता है। जीन मीटर को उसी तरह कैलिब्रेट करने की आवश्यकता होती है जिस तरह से pH मीटर को बफर्स के साथ कैलिब्रेट किया जाता है, इसका मतलब है कि नमूनों की तुलना करने के लिए कैलिब्रेटेड जांच को सामान्य करने की आवश्यकता नहीं है और माइक्रो-एरे सिग्नल की गैर-रैखिकता प्रकृति को ध्यान में रखा जाता है।
जीन मीटर दृष्टिकोण का उपयोग करते हुए, टीम ने पाया कि 548 ज़ेबरा मछली के जीन और 515 चूहे के जीन मृत्यु के बाद काफी हद तक अनियमित पाए गए। अनियमित जीनों में से अधिकांश मस्तिष्क में थे। मृत्यु के बाद इन जीनों के अनियमित होने का समय काफी भिन्न था, कुछ जीन मृत्यु के 48 घंटे बाद चरम पर थे। टीम यह प्रदर्शित करने में सफल रही कि ज़ेबरा मछली और चूहों के जिगर में पहचाने गए जीन का उपयोग करके मृत्यु के समय की भविष्यवाणी की जा सकती है। मस्तिष्क जीन विश्लेषण ने मृत्यु के समय के साथ कोई संबंध नहीं दिखाया।
इस अध्ययन का परिणाम ज्ञानवर्धक और दिलचस्प है। मानव शवों का उपयोग करके भविष्य के अध्ययनों में प्रत्यारोपण के लिए प्रस्तावित अंगों की गुणवत्ता निर्धारित करने के लिए एक PMI विकसित हो सकता है। जीन मीटर विधि स्वाभाविक रूप से PMI की भविष्यवाणी करने के लिए आनुवंशिक सामग्री का उपयोग करने में अशुद्धियों को कम करती है।
संदर्भ
- जीन मीटर अभिव्यक्ति डेटा के रैखिक प्रतिगमन विश्लेषण का उपयोग करके पोस्टमॉर्टम अंतराल की सटीक भविष्यवाणियां एम कोल्बी हंटर, अलेक्जेंडर पॉज़िटकोव, पीटर एंथनी नोबल बायोआरएक्सिव 058370; doi: http://dx.doi.org/10.1101/058370
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