إطلاق العنان للرعاية الدقيقة للسرطان من خلال تسلسل الجينوم الكامل

السرطان هو السبب الرئيسي للوفاة في جميع أنحاء العالم، وهو مسؤول عن حوالي 10 ملايين حالة وفاة في عام 2020 وفقًا لمنظمة الصحة العالمية. وعلى الرغم من التقدم الكبير الذي تم إحرازه في تطوير علاجات جديدة، لا يزال السرطان صعب التشخيص والعلاج بسبب طبيعته المعقدة. يمكن أن تختلف الأورام بشكل كبير بين المرضى وحتى داخل المريض نفسه بمرور الوقت مع تقدم المرض. ولتحسين نتائج المرضى، يحتاج أطباء الأورام إلى فهم أكثر شمولاً للتغيرات الجزيئية التي تؤدي إلى الإصابة بالسرطان لدى كل مريض على حدة.

توفر دراسة جديدة واسعة النطاق نُشرت في مجلة Nature Medicine رؤى مهمة لتحقيق هذا الهدف. قام باحثون من علم الجينوم في إنجلترا وهيئة الخدمات الصحية الوطنية في المملكة المتحدة بتحليل بيانات تسلسل الجينوم الكامل (WGS) من أكثر من 13800 ورم صلب في 33 نوعًا مختلفًا من السرطان. تؤكد النتائج التي توصلوا إليها، مقترنة بالسجلات السريرية الطولية، على قيمة الربط المنهجي بين بيانات الجينوم وبيانات العلاج في العالم الحقيقي على نطاق واسع. وفقًا للمؤلفين، تدعم النتائج التي توصلوا إليها التنفيذ السريري للمسح الجيني الوراثي العالمي (WGS) ولها آثار على تحسين رعاية مرضى السرطان من خلال استراتيجيات علاج أكثر تخصيصًا.

قامت الدراسة بتحليل بيانات تسلسل الجينوم التي تم إنشاؤها من خلال برنامج السرطان التابع لمشروع 100000 جينوم، وهي مبادرة لهيئة الخدمات الصحية الوطنية بقيادة علم الجينوم في إنجلترا. يوفر WGS ملفًا جزيئيًا كاملاً للورم من خلال الكشف عن التغيرات الجينومية المختلفة، بما في ذلك الطفرات الجينية، وتغيرات عدد النسخ والمتغيرات الهيكلية، من اختبار واحد. كشف تحليل هذه البيانات متعددة الجينوميات عن تشوهات قابلة للتنفيذ سريريًا في العديد من السرطانات التي تم تحليلها.

نظرة عامة على برنامج 100,000 جينوم للسرطان. أ، رحلة جينوم المريض. قدم المرضى موافقة خطية مستنيرة على إجراء تحليل الجينوم الوراثي الوراثي (WGS) للورم المزدوج والعينات الطبيعية (السلالة الجرثومية). تم استخلاص الحمض النووي من عينات الورم والعينات الطبيعية (الدم) باستخدام بروتوكولات موحدة وتم تقديم العينات لإجراء تحليل الجينوم الجيني الوراثي الوراثي العالمي الذي تم إجراؤه على جهاز تسلسل Illumina. تم إنشاء خط أنابيب آلي لمراقبة جودة التسلسل والمحاذاة واستدعاء المتغيرات وتفسيرها، مع إعادة النتائج إلى مراكز الطب الجينومي التابعة لهيئة الخدمات الصحية الوطنية ال 13 لمراجعتها في مراكز الطب الجينومي الإقليمية. في مشروع 100,000 جينوم، تتم متابعة المشاركين على مدار حياتهم باستخدام السجلات الصحية الإلكترونية (جميع نوبات المستشفى، وإدخالات تسجيل السرطان، والعلاجات النظامية المضادة للسرطان، وسبب الوفاة). ج، حلقة لا نهائية تمثل الرابط بين الرعاية الصحية والبحث في علم الجينوم. مقتبس من المرجع

على سبيل المثال، كانت الطفرات الجينية الصغيرة الموصى بها للاختبار القياسي حسب الإرشادات السريرية موجودة في أكثر من نصف الحالات في العديد من أنواع الأورام بما في ذلك الورم الأرومي الدبقي والورم الميلانيني الجلدي وسرطان القولون والمستقيم. أظهرت بعض أنواع السرطانات مثل الساركوما انتشارًا مرتفعًا بشكل خاص للمتغيرات البنيوية التي تؤثر على الجينات المهمة سريريًا. بالإضافة إلى ذلك، تم العثور على تشوهات في الجينات المشاركة في إصلاح الحمض النووي مثل BRCA1/2 في 40٪ من سرطانات المبيض، مما يؤكد قيمة دمج التحليلات الجينومية الجسدية والجينومية الجرثومية.

ولعل أبرز ما في الأمر أن الدراسة ربطت النتائج الجينومية بنتائج العلاج في العالم الحقيقي من خلال قواعد البيانات السريرية لهيئة الخدمات الصحية الوطنية في إنجلترا. كشف تصنيف أكثر من 1700 مريض بالسرطان وفقًا للعلامات الجزيئية عن إمكانات التنبؤ بنتائج العلاج. فوجود نقص إعادة التركيب المتماثل (HRD)، على سبيل المثال، تنبأ بقوة بتحسن البقاء على قيد الحياة بين مرضى سرطان الثدي والمبيض المعالجين بالبلاتين. وعلى العكس من ذلك، ارتبط ارتفاع عبء الطفرات الورمية بسوء التشخيص في سرطان الجلد.

تسلط هذه النتائج الضوء على الفائدة السريرية لفحص المسح الجيني الوراثي الجيني الشامل للمراقبة وتوجيه قرارات العلاج والتنبؤ بالاستجابة. من خلال الكشف عن التشوهات القابلة للتنفيذ عبر منصات اختبار متعددة من خلال اختبار واحد، يمكن أن يكون الاستقصاء الجيني الجيني العالمي بمثابة نهج التنميط الجزيئي في الخط الأول. في حين أن اللوحات المستهدفة تكشف عن تغيرات مهمة، فإن تغطيتها الجينية المحدودة قد تفوت فرص مطابقة المرضى للعلاجات الدقيقة الناشئة.

واستشرافاً للمستقبل، ستعتمد النتائج الواعدة للاستقصاء الجيني العالمي للأورام السرطانية على تكيف الأنظمة الصحية مع هذا المستوى الجديد من البيانات الجينومية. ستحتاج مراكز السرطان إلى فرق خبراء متعددة التخصصات، تُعرف باسم مجالس الأورام الجينومية، لتفسير نتائج المسح الجيني الوراثي الجيني بشكل موثوق وترجمة النتائج إلى قرارات رعاية شخصية. يمكن أن يساعد تطوير صيغ موحدة لإعداد التقارير وأدوات دعم القرارات السريرية في ضمان وصول هذه المعلومات المعقدة إلى الأطباء المعالجين. ومع انخفاض تكلفة المسح الجيني الوراثي الجينومي، فإن تحديد نماذج السداد العادلة سيكون أمرًا بالغ الأهمية أيضًا لضمان الوصول العادل.

ولعل الأهم من ذلك أنه يجب على الأنظمة الصحية إيجاد طرق لتغذية بيانات النتائج في العالم الحقيقي بشكل منهجي في الممارسة السريرية. ومن خلال التحليل المستمر للمجموعات الجينومية الكبيرة المرتبطة بالسجلات الصحية الإلكترونية، يمكن للباحثين تحسين المؤشرات الحيوية واكتشاف أهداف علاجية جديدة بمرور الوقت. سيستفيد الأطباء السريريون أيضًا من الاستعلام الروتيني عن قواعد بيانات النتائج وفقًا للملفات الجزيئية للمرضى. إن نهج النظام الصحي التعليمي هذا هو المفتاح للنهوض بعلم الأورام الدقيق وتعظيم تأثير مبادرات مثل مشروع 100000 جينوم.

إذا تم تطبيقه بنجاح، فإن المسح الجيني الوراثي الجيني العالمي يبشر بإحداث ثورة في رعاية مرضى السرطان. من خلال فهم الصورة الجزيئية الكاملة لكل ورم، يمكن لأطباء الأورام مطابقة المرضى الأفراد مع العلاجات المثلى أو التجارب السريرية أو الخيارات الاستقصائية. قد يصبح التنميط الجينومي يومًا ما جزءًا قياسيًا من فحص السرطان والتشخيص والمراقبة الطولية. والأهم من ذلك، مع تطور الأنظمة الصحية لدمج بيانات الجينوم والنتائج بشكل منهجي، فإننا نقترب أكثر من رؤية العلاج الدقيق للسرطان المصمم خصيصًا لكل مريض على حدة. سيتطلب تحقيق هذه الإمكانية تعاوناً مستمراً بين الباحثين وقادة الرعاية الصحية وصانعي السياسات، لكن دراسات كهذه تقدم دليلاً مشجعاً على أن ثمار علم الجينوم يمكن أن تترجم إلى فوائد سريرية في العالم الحقيقي على نطاق واسع.

المرجع (المراجع)

1. https://doi.org/10.1038/s41591-023-02682-0

انقر على TAGS للاطلاع على المقالات ذات الصلة :

علم الوراثة | الطب | علم الأورام | الصحة العامة